Fechas:
Del 5 al 30 de julio.
Plazo de Inscripción:
Hasta el 11 de Junio de 2010.
Los directores del curso:
-Luis Vazquez, catedrático de la Facultad de Informática de la UCM.
-Federico Morán Abad, catedrático de la Facultad de Químicas de la UCM. (Programa BIPEDD)
-Alfonso Valencia Herrera, Profesor de Investigación, director del programa de Biología Estructural y Biocomputación del CNIO.
Coordinador:
-Andrés Cañada Pallarés, Instituto Nacional de Bioinformática.
Curso:
Se celebra dentro de la Escuela Complutense de Verano, inscrito en la Escuela de Informática y Nuevas Tecnologías,que tiene lugar durante el mes de Julio, con capacidad para 20 alumnos.
En este curso se pretende formar a los alumnos en el manejo de técnicas y metodologías que son de gran utilidad para trabajar en el área de la Bioinformática. El curso es teórico y práctico y, por tanto, no sólo se pretende que los alumnos adquieran conocimientos generales en este tema, sino que alcancen un nivel de formación básico que les permita utilizar los programas y herramientas disponibles con soltura.
El curso está abierto a doctores, licenciados o estudiantes de cualquier carrera de Ciencias o Ingeniería. Sin embargo es recomendable que los alumnos tengan:
- Conocimientos elementales de biología molecular.
- Conocimientos básicos de manejo de computadores.
- Conocimientos de inglés.
Las ediciones anteriores, también celebradas en el contexto de la Escuela Complutense de Verano, tuvieron una excelente acogida y fueron evaluadas positivamente por los alumnos, tanto en la encuesta que realiza la Fundación, como en la que realizan los directores del curso. La valoración general obtenida por el curso en las pasadas ediciones ha variado entre 6.8 y 8. Los contenidos de los cursos anteriores, las listas de profesores y alumnos que participaron y
los resultados detallados de las encuestas realizadas a los alumnos, son accesibles aquí:
- Curso de Verano 2002
- Curso de Verano 2003
- Curso de Verano 2004
- Curso de Verano 2005
- Curso de Verano 2006
- Curso de Verano 2007
- Curso de Verano 2008
Los Objetivos del curso son:
-Adquirir conocimientos elementales del sistema operativo Linux, de programación en Perl y de diseño e implementación de bases de datos relacionales. Linux, como otros sistemas operativos emparentados con Unix, es la
plataforma preferida para el desarrollo y el uso de aplicaciones bioinformáticas, Perl es un lenguaje de programación frecuentemente usado para el desarrollo de pequeñas aplicaciones bioinformáticas y las bases de datos relacionales son sistemas estándar de almacenamiento, análisis y consulta de datos.
- Familiarizarse con los tipos de datos que son objeto de análisis en la Bioinformática, y con las bases de datos en que dichos datos están almacenados y cómo se accede a ellas a través de la Internet.
- Conocer los tipos de herramientas y las estrategias generales de investigación usadas más frecuentemente en Bioinformática. Este objetivo es muy amplio y abarca técnicas y métodos enfocados a analizar y comparar secuencias de ácidos nucleicos, analizar y anotar genomas, predecir y comparar la estructura y la función de proteínas, diseñar fármacos optimizados para su interacción con centros activos de enzimas o receptores o con ácidos nucleicos, etc.
Los temas principales que se tratan en este curso son
• Introducción a la Bioinformática.
• Nociones sobre el uso de computadores con sistema operativo tipo Linux.
• Programación básica con Perl.
• Nociones sobre bases de datos relacionales y servicios Web.
• Bases de Datos en Bioinformática.
• Herramientas y conceptos de análisis de secuencias de acidos nucléicos.
• Herramientas y conceptos de análisis de secuencias de aminoácidos.
• Predicción de estructura secundaria y terciaria de proteínas.
• Arrays de DNA y análisis de datos.
• Proteómica y Bioinformática.
Los alumnos de este curso son evaluados por la calificación que reciban en trabajos individuales y/o de grupo, y mediante el seguimiento de su participación en las clases.
Los trabajos consistirán en la redacción de memorias sobre ejercicios prácticos propuestos en clase y/o de comentarios críticos sobre publicaciones científicas relacionadas con el temario.
Actividades Prácticas:
El número de horas de clase dedicadas a temas que previsiblemente incluirán actividades prácticas con ordenador es de unas 75. Estas clases aparecen con fondo gris en el cronograma que se presenta más abajo. Las prácticas estarán organizadas por el mismo profesor que imparte la clase, que será también el que decida la duración de las mismas. No obstante, la recomendación general será dividir el tiempo de clase en dos mitades, una para teoría y otra para práctica.
Si se cumple esta recomendación, el tiempo previsto de prácticas es de alrededor de 37 horas.
Está previsto organizar al menos dos sesiones dedicadas en su totalidad a la realización de prácticas. En la primera, las prácticas estarán centradas en “análisis de secuencias”; en la segunda, el tema será “predicción de estructura de proteínas”. Las prácticas servirán para integrar y reforzar los temas tratados a lo largo de las jornadas anteriores, y tendrán una parte guiada y otra libre.
Por último, se ofrecerá a los alumnos la posibilidad de realizar prácticas adicionales, libres o apoyadas por un monitor, en horas extra, dependiendo de la disponibilidad del aula.
Horario:
De 9:00 a 14:00 todos los días lectivos
Lugar de celebración (clases teóricas y prácticas):
Facultad de Informática de la UCM.
Av. Complutense s/n- Ciudad Universitaria.
Laboratorio nº4 de Informática 2ª Planta
Duración:
100 horas.
Cierre del período de matrícula:
11 de junio 2010
Otros Datos
Nº de créditos de libre configuración: 8 (sólo alumnos UCM).
Lugar de celebración: Universidad Complutense de Madrid.
Precio de la matrícula: 900 Euros
Ayudas: Las de caracter general
